Nexus 6を完全に初期化し、Android Mを導入しようと思います。作業に使うOSはMacですが基本的にWindowsも同様のコマンドを利用できます。
ダウンロード：https://developer.android.com/preview/download.html
まずダウンロードしたファイルをわかりやすい所に解凍します。
同時に内部のimage-shamu-MPZ44Q.zipも解凍しておきましょう。
shamu-MPZ44Qでコマンド入力を行います。cdで移動すると楽ちんです。
以下のコマンドはshamu-MPZ44Q用の物なので今後バージョンが変わると使えなくなること間違いなしです。
fastboot flash bootloader bootloader-shamu-moto-apq8084-71.11.img
fastboot flash radio radio-shamu-D4.01-9625-05.16+FSG-9625-02.94.img
今度はimage-shamu-MPZ44Qに移動して次のコマンドを打ちます。
fastboot flash boot boot.img
fastboot flash cache cache.img
fastboot flash recovery recovery.img
fastboot flash system system.img
fastboot flash userdata userdata.img
fastboot format userdata
fastboot format cache
fastboot reboot
最後の3つのコマンドを打ち込んでいる理由はこれです。